Pagrindinis skirtumas tarp trumpalaikio ir subalansuoto polimorfizmo yra pagrįstas alelių elgesiu. Laikinas polimorfizmas yra laipsniškas vieno geno alelio pakeitimas kitu aleliu, o subalansuotas polimorfizmas yra abiejų skirtingų geno alelių išlaikymas laikui bėgant
Genetinis polimorfizmas yra vienas ar du ar daugiau tam tikros DNR variantų. Laikinas ir subalansuotas polimorfizmas yra dviejų tipų polimorfizmas, atsirandantis dėl dviejų pakaitinių geno alelių. Esant trumpalaikiam polimorfizmui, iš dviejų pakaitinių tam tikro lokuso alelių vienas alelis laipsniškai keičiamas kitu. Subalansuotame polimorfizme abu aleliai yra pusiausvyroje. Abi geno versijos yra palaikomos populiacijoje.
