Pagrindinis skirtumas tarp chromosomų juostų ir dažymo chromosomomis yra tas, kad chromosomų juostos yra dažymo technika, rodanti chromosomų regionus atskiromis tamsiomis ir šviesiomis juostomis, tačiau chromosomų dažymas yra hibridizacijos technika, kai konkretūs chromosomų regionai ar segmentai yra dažomi konkrečiai sekai fluorescuojančiai pažymėti zondai.
Citogenetikoje būtina sukurti matomą organizmo kariotipą, kad būtų galima nustatyti chromosomas ir jų aberacijas. Chromosomų juostos ir dažymas yra du citogenetiniai metodai, kurie padeda vizualizuoti chromosomas. Abi technikos yra naudingos nustatant genetinius sutrikimus.