Pagrindinis skirtumas tarp RQ ir RER yra tas, kad RQ yra tiesioginis matavimas, paimtas iš kraujo ir RER netiesioginiu matavimu per kvėpavimą.
Kalorimetrija matuoja šilumos kiekį, išsiskiriantį dėl medžiagų apykaitos arba energijos sąnaudas. Metabolizmui reikalingas deguonis ir jis gamina anglies dioksidą. Kvėpavimo koeficientas (RQ) ir Kvėpavimo mainų santykis (RER) yra du panašūs kalorimetrijos matavimai. Tačiau RQ yra tiesioginis matavimas, paimtas iš kraujo. Tai metabolinis dujų santykio pasikeitimas yra lygus CO 2 gamybai per deguonies pasisavinimą (CO 2 / O 2). RER yra netiesioginis matavimas, matuojamas per kvėpavimą. Todėl RQ yra invazinis metodas, o RER yra neinvazinis metodas.