Pagrindinis skirtumas tarp mezenchiminių ir kraujodaros kamieninių ląstelių yra tas, kad mezenchiminės kamieninės ląstelės gali diferencijuotis į neuronų, kaulų, kremzlių, raumenų ir riebalinio audinio ląsteles, o kraujodaros kamieninės ląstelės - į visų rūšių kraujo ląsteles mūsų kūne.
Kamieninės ląstelės yra nediferencijuotos arba nespecializuotos ląstelės, esančios mūsų kūne. Jie sugeba padalinti ir suteikti to paties tipo kamienines ląsteles arba diferencijuotis į specializuotas audinių ląsteles, turinčias nurodytas funkcijas. Dėl šių nepaprastų kamieninių ląstelių gebėjimų jie naudojami atstatant ir regeneruojant pažeistus audinius. Mesenchiminės kamieninės ląstelės ir kraujodaros kamieninės ląstelės yra dviejų tipų kamieninės ląstelės, kurios yra nepaprastai svarbios. Mesenchiminės kamieninės ląstelės (ne kraujodaros kamieninės ląstelės) yra daugiapotencinės kamieninės ląstelės, galinčios generuoti kaulų, kremzlių ir riebalų ląsteles. Kita vertus, kraujodaros kamieninės ląstelės gali sudaryti visų rūšių kraujo ląsteles organizme. Be to, abu šie kamieninių ląstelių tipai yra kaulų čiulpuose.