Pagrindinis skirtumas tarp chromatino ir chromosomų yra tas, kad chromatinas yra neišpainiota ir išskleista DNR, kuri egzistuoja kaip DNR ir histono baltymų kompleksas, o chromosomose yra aukščiausia DNR dvigubos spiralės kondensuota struktūra, kad būtų galima tinkamai atskirti genetinę medžiagą tarp dukterinių ląstelių.
Chromatinas ir chromosomos yra dvi DNR dvigubos spiralės struktūrų kategorijos, esančios skirtinguose ląstelės etapuose. Būtina supakuoti visą DNR, saugančią genetinę ląstelės informaciją, egzistavimui į eukariotinį branduolį. Taigi chromatinas yra įprasta supakuotos DNR forma ląstelėje. Kita vertus, chromosomos yra svarbiausios ląstelės struktūros ląstelių dalijimosi metu ir jose yra genetinė medžiaga DNR pavidalu. Taip yra todėl, kad jie yra atsakingi už paveldimos informacijos perdavimą iš vienos kartos į kitą. Yra dviejų tipų chromosomos: autosomos ir lyties chromosomos. Lytinės chromosomos yra svarbios nustatant lytį, o autosomos lemia kitas savybes. Paprastai chromosomos atsiranda ląstelių dalijimosi metafazės metu.
