Pagrindinis skirtumas tarp prostaglandino E1 ir E2 yra tas, kad prostaglandinas E1 (PGE1) yra priešuždegiminis veiksnys, o prostaglandinas E2 (PGE2) yra uždegimą skatinantis veiksnys.
Prostaglandinai yra lipidų dariniai, turintys hormonų funkciją. Jie gali veikti kaip autokrininiai ar parakrininiai junginiai, sukeliantys antagonistinį ar sinergistinį poveikį gyviesiems organizmams. Prostaglandinas E1 ir prostaglandinas E2 yra dviejų tipų, kurie skiriasi dėl uždegimo funkcionalumo. Tiek prostaglandinas E1, tiek E2 priklauso tai pačiai prostaglandino E2 šeimai, jų reakcijos pagrindas ir poveikis dar nėra visiškai išaiškintas. Jie naudojami gydant įvairius gyvų būtybių biocheminius mechanizmus.