Pagrindinis skirtumas tarp pluripotentinių ir indukuotų pluripotentinių kamieninių ląstelių yra tas, kad pluripotentinės ląstelės yra nediferencijuotos motininės ląstelės (iš embrionų ir kt.), Kurios turi natūralų gebėjimą diferencijuotis į skirtingus ląstelių tipus, o sukeltos pluripotentinės kamieninės ląstelės yra somatinės suaugusios ląstelės, turinčios buvo genetiškai perprogramuoti, kad būtų panašios į natūralias pluripotentines kamienines ląsteles.
Kamieninė ląstelė yra nediferencijuota ląstelė, turinti unikalų gebėjimą išsivystyti į skirtingas arba specializuotas ląsteles. Be to, kamieninės ląstelės yra trijų tipų, būtent unipotentinės, pluripotentinės ir multipotentinės. Jei kamieninė ląstelė gali diferencijuotis į vieną, kelias ir į visų tipų ląsteles, ji yra atitinkamai žinoma kaip vienpotentė, daugiapotencinė arba pluripotentinė kamieninė ląstelė. Tarp pirmiau minėtų trijų tipų pluripotentinės kamieninės ląstelės yra svarbios, nes jos gali diferencijuotis į visus ląstelių tipus. Pluripotentinė embriono kamieninė ląstelė gali išsivystyti į visą žmogų.
