Pagrindinis skirtumas tarp substrato ir aktyviosios vietos yra tas, kad substratas yra cheminis junginys, kuris gali patirti cheminę reakciją, o aktyvioji vieta yra specifinis fermento regionas.
Fermentai yra biologiniai katalizatoriai. Tai yra baltymai, kurie gali sumažinti cheminės reakcijos aktyvacijos energiją, kad sumažintų tos reakcijos energijos barjerą. Vadinasi, tai gali padidinti reakcijos greitį. Reakcijos, kurioje dalyvauja fermentai, reagentas yra „substratas“. Šis substratas jungiasi su aktyvia fermento vieta. Reakcijos vyksta ten. Galų gale jis išskiria reakcijos produktus.
