Pagrindinis skirtumas tarp pirminių ir antrinių alilinių karbokacijų yra tas, kad pirminė alilo karbokacija yra mažiau stabili nei antrinė alilo karbokacija.
Alilo karbokacija yra rezonansu stabilizuota anglies struktūra. Tai jonas, turintis teigiamą krūvį. Šiuose jonuose teigiamas jonas dedamas ant alilo anglies atomo (alilo anglies atomas yra gretimas dvigubo ryšio atomas). Pirminė alilinė karbokacija yra alilo karbokacija, kai teigiamas krūvis dedamas ant pirminio anglies atomo, o antrinė alilo karbokacija yra alilo karbokacija, kai teigiamas krūvis dedamas ant antrinio anglies atomo.
