Pagrindinis skirtumas tarp sintenijos ir kolineariškumo yra tas, kad sintenija yra fizinė genetinių lokusų lokalizacija toje pačioje chromosomoje rūšyse, o kolineariškumas yra fizinis genetinių lokusų lokalizavimas toje pačioje chromosomoje skirtingose rūšyse, išsaugant tą pačią tvarką.
Sintetija ir kolinearumas yra du terminai, kurie genomikoje vartojami pakaitomis. Abu terminai apibūdina skirtingų rūšių chromosomų genų lokalizacijos modelius. Šie susiję taksonų genų susitarimai yra vertinga informacija darant išvadą apie bendrą genų kilmę. Sintetija nurodo fizinę genetinių lokusų lokalizaciją toje pačioje chromosomoje rūšyse. Kolinearumas reiškia fizinį genetinių lokusų tą pačią chromosomą lokalizaciją skirtingose rūšyse, išsaugant tą pačią tvarką. Todėl tai yra sintezės forma.