Pagrindinis skirtumas tarp panašumo ir tapatumo sekos derinime yra tas, kad panašumas yra panašumas (panašumas) tarp dviejų sekų, kai tapatumas yra simbolių skaičius, tiksliai atitinkantis dvi skirtingas sekas.
Bioinformatika yra tarpdisciplininė mokslo sritis, daugiausia susijusi su molekuline biologija ir genetika, informatika, matematika ir statistika. Sekos derinimas yra pagrindinis bioinformatikos terminas. Tai procedūra, kurios metu DNR, RNR ar baltymo sekos yra išdėstytos panašumo regionams nustatyti, kuris yra funkcinių, struktūrinių ar evoliucinių ryšių tarp sekų pasekmė. Lygiavimo pabaigoje jie bus pateikti kaip eilutės matricoje. Siekiant išlyginti identiškus simbolius iš eilės esančiose kolonose, tarp liekanų yra įterptų spragų.