Pagrindinis skirtumas tarp kraujo smegenų barjero ir kraujo CSF barjero yra tas, kad kraujo smegenų barjeras yra barjeras, skiriantis kraujo audinį ir smegenų audinį, o kraujo CSF barjeras yra funkcinis barjeras, skiriantis kraujo audinį ir smegenų skystį.
Kraujo smegenų barjeras ir kraujo CSF barjeras yra du apsauginiai barjerai smegenyse. Be to, jie yra svarbūs perduodant molekules per smegenis ir periferinio kraujo audinius. Be to, abu barjerai turi tvirtas jungtis, palengvinančias netoksiškų junginių perdavimą į smegenis.
