Pagrindinis skirtumas tarp homologinių struktūrų ir vestigialinių struktūrų yra tas, kad homologinės struktūros yra anatomiškai panašios struktūros, esančios skirtinguose organizmuose, turinčiuose bendrą protėvį, o vestigialinės struktūros yra anatominės struktūros, kurios prarado naudingumą organizmui.
Homologinės struktūros yra vestigialinės struktūros - tai dviejų rūšių anatominės struktūros, kurios yra evoliuciškai svarbios. Homologinės struktūros yra panašios struktūros, esančios skirtinguose organizmuose, kilusiuose iš bendro protėvio. Priešingai, vestigialinės struktūros yra struktūros, kurios organizmams nebėra naudingos ir turi mažesnį dydį.