Pagrindinis skirtumas tarp kotransporto ir kontrtransporto yra tas, kad bendras transportas yra antrinio aktyvaus transporto forma, kuri tuo pačiu metu per plazmos membraną perneša dviejų tipų molekules ta pačia kryptimi arba priešinga kryptimi. Kita vertus, kontratransportas yra viena iš dviejų kotransporto formų, kuri vienu metu per ląstelės membraną viena prieš kitą nukreipia dviejų tipų molekules.
Molekulės eina ir išeina per selektyvią ląstelės plazmos membraną. Yra keletas membraną pernešančių baltymų tipų. Komercinis transportas ir kontratransportas yra dvi antrinio aktyvaus transporto rūšys. Cotransport transportuoja du skirtingus molekulių tipus tuo pačiu metu sujungtu judesiu, o kontrtransportas arba mainai yra kotransporto rūšis, kuri perduoda dviejų tipų molekules priešinga kryptimi per membraną.
