Esminis skirtumas tarp hidrokrekingo ir vandens apdorojimo yra tas, kad hidrokrekingas apima aukšto virimo temperatūros komponentų virtimą žemos virimo temperatūros sudedamosiomis dalimis, tuo tarpu hidrovandeninis krekingas apima deguonies ir kitų heteroatomų pašalinimą.
Hidrokrekingas ir hidrinimas yra naudingi naftos naftos perdirbimo procesai. Šie du procesai priskiriami vandenilio perdirbimo kategorijai. Be to, abu šie procesai vyksta dalyvaujant vandenilio dujoms. Tačiau pagal principą ir mechanizmą yra akivaizdus skirtumas tarp hidrokrekingo ir vandens apdorojimo.