Pagrindinis skirtumas tarp parazitinių šaknų ir mikorizų yra tas, kad parazitinės šaknys yra nefotosintetinių parazitinių augalų šaknys, o mikorizės yra savitarpio asociacijos rūšis, egzistuojanti tarp fotosintetinių aukštesnių augalų šaknų ir grybelio.
Parazitizmas ir tarpusavio ryšys yra dvi simbiotinės asociacijos, egzistuojančios tarp dviejų skirtingų kartu gyvenančių rūšių. Parazitizmas naudingas tik parazitams, nes parazitas gauna maisto produktus ir kitus reikalavimus iš šeimininko, tuo pačiu pakenkdamas. Kita vertus, abipusis ryšys naudingas abiem asociacijoje esantiems partneriams. Mikorizos yra savitarpio asociacijos tipas, atsirandantis tarp aukštesnio augalo ir grybo. Grybas gyvena aukštesnių augalų šaknyse. Aukštesni augalai suteikia grybui maisto, o grybas absorbuoja vandenį ir maistines medžiagas iš dirvožemio į augalą.
