Pagrindinis skirtumas tarp ribozimų ir baltymų fermentų yra tas, kad ribozimai yra RNR molekulės, galinčios katalizuoti tam tikras specifines biochemines reakcijas, o baltymų fermentai yra baltymų molekulės, galinčios katalizuoti didžiąją dalį gyvų organizmų biocheminių reakcijų.
Fermentai yra biologiniai katalizatoriai, kurie pagreitina biocheminių reakcijų greitį. Paprastai visi fermentai yra baltymai, sudaryti iš aminorūgščių. Taigi jie taip pat vadinami baltymų fermentais. Tačiau yra specifinių RNR molekulių, kurios gali veikti kaip specifinių biocheminių reakcijų katalizatoriai. Jie yra ribozimai arba ribonukleino rūgšties fermentai. Todėl tiek ribozimai, tiek baltymų fermentai atlieka tą pačią funkciją, kaip ir biocheminių reakcijų katalizavimas.
