Pagrindinis skirtumas tarp epistatinio geno ir hipostatinio geno yra tas, kad epistatinis genas yra genas, kuris daro įtaką kito geno ekspresijai skirtingoje vietoje, o hipostatinis genas yra genas, veikiantis epistatinio geno kišimąsi.
Tam tikri genai priklauso nuo kitų nealelinių genų. Epistasis yra genų sąveikos forma, kai vienas genas trukdo arba užmaskuoja kito geno, esančio kitoje vietoje, išraišką. Vadinasi, tai yra nealelinių genų sąveika. Šioje specialioje genų sąveikoje sąveikauja du genai, jie yra epistatinis ir hipostatinis genas. Atitinkamai genas, užmaskuojantis kito geno išraišką, yra žinomas kaip epistatinis, o genas, kurio ekspresija yra paveikta, žinomas kaip hipostatinis.
