Pagrindinis skirtumas tarp DNR ir chromosomos yra jų struktūros organizavimas. DNR yra dvigubos grandinės suvyniotas polimeras, susidedantis iš dezoksiribonukleotidų, o chromosoma yra struktūra kaip siūlas, susidedanti iš DNR molekulių, glaudžiai susisukusių su histono baltymais.
DNR ir chromosomos yra du skirtingi genetinės medžiagos struktūrinių organizacijų lygiai. DNR yra paprastesnė struktūra, susidedanti iš dvigubos nukleotidų spiralės. Priešingai, chromosomos yra sudėtinga, organizuota struktūra, susidedanti iš baltymų ir DNR, sulankstytų tam tikru būdu. Nors DNR ir chromosomos skiriasi viena nuo kitos struktūrų organizavimu, joms tenka pagrindinis vaidmuo nustatant organizmo fizines ir funkcines savybes pagal saugomą paveldimą medžiagą.