Pagrindinis skirtumas tarp organinės chemijos ir neorganinės chemijos yra tas, kad organinė chemija yra chemijos sritis, nagrinėjanti organinių junginių struktūrą, savybes, reakcijas ir kitus faktus, o neorganinė chemija yra neorganinių junginių chemijos sritis.
Chemija iš esmės yra mokslo šaka, susijusi su medžiagomis, iš kurių susideda medžiaga, jų savybių ir reakcijų tyrimu ir tokių reakcijų naudojimu formuojant naujas medžiagas. Kai sakome „organinė chemija“, ji susijusi su organiniais junginiais, o „neorganinė chemija“- su neorganiniais junginiais.