Pagrindinis skirtumas tarp klasikinės ir šiuolaikinės genetikos yra tas, kad klasikinė genetika yra Mendelio genetika arba senesnė genetikos samprata, kuri išreikšta tik remiantis veisimo eksperimentų rezultatais, o šiuolaikinė genetika yra nauja genetikos samprata, leidžianti tiesiogiai genotipų ir fenotipų tyrimas.
Didysis mokslininkas Gregoras Mendelis yra genetikos tėvas. Mendelis pristatė keletą įstatymų, susijusių su bruožų paveldėjimu ir kaip bruožai pereina iš tėvų į palikuonis. Taigi jo išvados tapo visiškai naujos koncepcijos, atrastos vėliau genetikoje, pagrindu. Todėl klasikinė genetika ir šiuolaikinė genetika yra dvi skirtingos sąvokos. Tačiau klasikinė genetika yra šiuolaikinės genetikos pagrindas.
