Pagrindinis skirtumas - I tipo ir II tipo apribojimų fermentai
Ribojimo fermentas, dažniausiai vadinamas restrikcijos endonukleaze, turi galimybę suskaidyti DNR molekules į mažus fragmentus. Šis skilimo procesas vyksta šalia arba specialioje DNR molekulės atpažinimo vietoje, vadinamoje restrikcijos vieta. Atpažinimo svetainę paprastai sudaro 4–8 bazių poros. Priklausomai nuo skilimo vietos, restrikcijos fermentai gali būti keturių skirtingų tipų; I, II, III ir IV tipai. Be skilimo vietos, diferencijuojant restrikcijos fermentus į keturias grupes, atsižvelgiama į tokius veiksnius kaip sudėtis, bendrų faktorių reikalavimas ir tikslinės sekos būklė. Skaldant DNR molekulę, skilimo vieta gali būti arba pačioje restrikcijos vietoje, arba per atstumą nuo restrikcijos vietos. DNR skaidymo proceso meturestrikcijos fermentai sukuria du pjūvius per kiekvieną cukraus fosfato pagrindą dviguboje DNR spiralėje. Ribojimo fermentų daugiausia yra Achajoje ir bakterijose. Šiuos fermentus jie naudoja kaip gynybos mechanizmą nuo įsiveržiančių virusų. Ribojimo fermentai skaido svetimą (patogeninę) DNR, bet ne savo DNR. Jo paties DNR apsaugo fermentas, žinomas kaip metiltransferazė, kuris modifikuoja DNR šeimininką ir apsaugo nuo skilimo. I tipo restrikcijos fermentas turi skilimo vietą, esančią atokiau nuo atpažinimo vietos. II tipo restrikcijos fermentai suskyla pačioje atpažinimo vietoje arba arčiau jos. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp I ir II tipo restrikcijos fermentų. Ribojimo fermentų daugiausia yra Achajoje ir bakterijose. Šiuos fermentus jie naudoja kaip gynybos mechanizmą nuo įsiveržiančių virusų. Ribojimo fermentai skaldo svetimą (patogeninę) DNR, bet ne savo DNR. Jo paties DNR apsaugo fermentas, žinomas kaip metiltransferazė, kuris modifikuoja DNR šeimininką ir apsaugo nuo skilimo. I tipo restrikcijos fermentas turi skilimo vietą, esančią atokiau nuo atpažinimo vietos. II tipo restrikcijos fermentai suskyla pačioje atpažinimo vietoje arba arčiau jos. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp I ir II tipo restrikcijos fermentų. Ribojimo fermentų daugiausia yra Achajoje ir bakterijose. Šiuos fermentus jie naudoja kaip gynybos mechanizmą nuo įsiveržiančių virusų. Ribojimo fermentai skaido svetimą (patogeninę) DNR, bet ne savo DNR. Jo paties DNR apsaugo fermentas, žinomas kaip metiltransferazė, kuris modifikuoja DNR šeimininką ir apsaugo nuo skilimo. I tipo restrikcijos fermentas turi skilimo vietą, esančią atokiau nuo atpažinimo vietos. II tipo restrikcijos fermentai suskyla pačioje atpažinimo vietoje arba arčiau jos. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp I ir II tipo restrikcijos fermentų. Jo paties DNR apsaugo fermentas, žinomas kaip metiltransferazė, kuris modifikuoja DNR šeimininką ir apsaugo nuo skilimo. I tipo restrikcijos fermentas turi skilimo vietą, esančią atokiau nuo atpažinimo vietos. II tipo restrikcijos fermentai suskyla pačioje atpažinimo vietoje arba arčiau jos. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp I ir II tipo restrikcijos fermentų. Jo paties DNR apsaugo fermentas, žinomas kaip metiltransferazė, kuris modifikuoja DNR šeimininką ir apsaugo nuo skilimo. I tipo restrikcijos fermentas turi skilimo vietą, esančią atokiau nuo atpažinimo vietos. II tipo restrikcijos fermentai suskyla pačioje atpažinimo vietoje arba arčiau jos. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp I ir II tipo restrikcijos fermentų.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra I tipo restrikcinis fermentas
3. Kas yra II tipo restrikcinis fermentas
4. I ir II tipo restrikcinio fermento panašumai
5. Gretimas palyginimas - I tipo ir II tipo ribojimo fermentai lentelių pavidalu
6. Santrauka
Kas yra I tipo ribojimo fermentas?
I tipo restrikcijos fermentai yra pentameriniai baltymai, susidedantys iš trijų daugelio subvienetų: restrikcijos subvieneto, metilinimo subvieneto ir DNR sekos atpažinimo subvieneto. Šie subvienetai nėra tapatūs. Iš pradžių jie buvo identifikuoti dviem skirtingomis Escherichia coli formomis. Šių restrikcijos fermentų skilimo vieta yra skirtinguose atsitiktiniuose taškuose, paprastai 1000 bazių porų nuo atpažinimo vietos. Šiems restrikcijos fermentams reikalingas ATP, Mg 2+ir S-adenosil-L-metioninas jo aktyvavimui. I tipo restrikcijos fermentai turi ir metilazės, ir restrikcijos aktyvumą. Bakterijos naudoja restrikcijos fermentus kaip ląstelių apsaugos mechanizmą nuo įsiveržiančių virusų. Ribojimo fermentai suskaido viruso DNR ir jas sunaikina. Tačiau siekiant užkirsti kelią savo paties šeimininko DNR skilimui, I tipo restrikcijos fermentas užtikrina metilinimo apsaugą. Tai modifikuoja šeimininko DNR ir apsaugo nuo skilimo. Nors šie restrikcijos fermentai yra biochemiškai svarbūs, jie nėra plačiai naudojami, nes juose nėra atskirų restrikcijos fragmentų ar gelio jungimosi modelių.
Kas yra II tipo ribojimo fermentai?
II tipo restrikcijos fermentų struktūroje yra du identiški subvienetai. Homodimerus sudaro II tipo restrikcijos fermentai su atpažinimo vietomis. Atpažinimo vietos paprastai yra palindrominės ir yra nedalomos. Jo ilgis yra 4-8 bazinės poros. Skirtingai nuo I tipo, II tipo restrikcijos fermento skilimo vieta yra atpažinimo vietoje arba yra netoli atstumo nuo atpažinimo vietos.
02 paveikslas: II tipo ribojimo fermentai
Šie restrikcijos fermentai yra reikšmingi biochemiškai ir yra plačiai prieinami komerciškai. Norint jį suaktyvinti, reikia tik Mg 2+. Jis neturi metilinimo aktyvumo ir teikia tik restrikcinio aktyvumo funkciją. Šie restrikcijos fermentai prisijungia prie DNR molekulių kaip homodimerai ir turi galimybę atpažinti simetriškas DNR sekas ir asimetrines sekas.
Kuo panašūs I ir II tipo restrikciniai fermentai?
- I ir II tipo restrikcijos fermentai yra fermentų tipai - tai restrikcijos endonukleazės, susijusios su DNR molekulių skilimu į mažesnius fragmentus.
- Abi yra naudingos molekulinės biologijos metodams.
Koks skirtumas tarp I ir II tipo restrikcinių fermentų?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
I tipo ir II tipo ribojimo fermentai |
|
| I tipo restrikcijos fermentas yra DNR restrikcijos fermentas, kuris skaido DNR atsitiktinėse vietose toli nuo savo atpažinimo vietos. | II tipo restrikcijos fermentas yra DNR restrikcijos fermentas, kuris skaido DNR apibrėžtose vietose šalia ar atpažinimo vietos. |
| Kompozicija | |
| I tipo restrikcijos fermentas yra kompleksinis fermentas, kurį sudaro trys (03) nenustatyti subvienetai. | II tipo restrikcijos fermentas yra paprastas fermentas, kurį sudaro du vienodi subvienetai. |
| Molekulinė masė | |
| I tipo restrikcijos fermentas sveria 400 000 daltonų. | II tipo restrikcijos fermento svoris svyruoja nuo 20 000 iki 100 000 daltonų. |
| Skilimo seka | |
| I tipo restrikcijos fermento skilimo seka nėra specifinė. | II tipo restrikcijos fermentas turi specifinę skilimo seką. |
| Skilimo vieta | |
| Skilimo vieta yra 1000 nukleotidų atstumu nuo I tipo restrikcijos fermentų atpažinimo vietos. | Skilimo vieta yra atpažinimo vietoje arba nedideliu atstumu nuo atpažinimo vietos esant II tipo restrikcijos fermentui. |
| Kofaktoriai aktyvavimui | |
| I tipo restrikcijos fermentui aktyvuoti reikia ATP, Mg 2+ ir S-adenosil-L-metionino. | Norint suaktyvinti II tipo restrikcijos fermentą, reikalingas tik Mg2 +. |
| Metilinimo veikla | |
| I tipo fermentas apsaugo DNR metilinimo būdu. | II tipo restrikcijos fermentuose nėra metilinimo aktyvumo. |
| Fermento veikla | |
| I tipo restrikcijos fermentas suteikia ir endonukleazės (restrikcijos), ir metilinimo veiklą. | II tipo restrikcijos fermentas suteikia tik restrikcijos aktyvumą. |
| Pavyzdžiai | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Santrauka - I tipo ir II tipo ribojimo fermentai
Ribojantys fermentai vadinami biologinėmis žirklėmis, kurios suskaido DNR molekules į mažesnes medžiagas. Ribojimo fermentai yra diferencijuojami į 04 skirtingų kategorijų, atsižvelgiant į skilimo vietos vietą, atsižvelgiant į atpažinimo vietą, esamus veiksnius, tikslinės sekos sudėtį ir būklę. Už jo aktyvavimą, I tipo restrikcijos fermentais reikalauja ATP, Mg 2+, ir S-adenosil-L-metionino. I tipo restrikcijos fermento skilimo vieta paprastai yra 1000 bazių porų nuo atpažinimo vietos ir užtikrina metilazės apsaugą DNR. II tipo apribojimų fermentams reikalingas tik Mg 2+jo aktyvavimui. Skilimo vieta yra atpažinimo vietoje arba netoli jos. Jis neturi metilinimo aktyvumo ir yra plačiai prieinamas prekyboje. Tai yra skirtumas tarp I tipo restrikcijos fermento ir II tipo restrikcijos fermento.
Atsisiųskite I tipo ir II tipo apribojimų fermento PDF versiją
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia. Skirtumas tarp I ir II tipo apribojimų fermentų.
