Pagrindinis skirtumas tarp V tipo ir F tipo ATPazės yra tas, kad V tipo ATPazė veikia kaip ATP valdomas jonų siurblys, o F tipo ATPazė ląstelėse veikia kaip ATP sintazė.
ATPazė yra terminas, nurodantis fermentus, gebančius hidrolizuoti ATP. Paprastai ATPazės suskaido ATP ir reakcijos metu išsiskyrusi energija naudojama darbui atlikti, nes ATP yra energijos valiuta, teikianti energiją visiems ląstelių procesams. ATP suskirstymui reikalingos ATPazės. Todėl ATPazės sumažina ATP hidrolizės aktyvacijos energiją. Yra keturi pagrindiniai ATPazių tipai: F-ATPazės, V-ATPazės, A-ATPazės ir P-ATPazės. V tipo ATPazės pirmiausia randamos eukariotinių ląstelių vakuolėse. Priešingai, F tipo ATPazės yra bakterijų plazmos membranose, mitochondrijų vidinėje membranoje ir chloroplastuose. Jie katalizuoja ATP sujungimo su H + (arba Na +) transportu per membraną hidrolizę ar sintezę.
