Pagrindinis skirtumas - DNR polimerazė 1 prieš 2 ir 3
DNR polimerazė yra speciali fermentų grupė, dalyvaujanti gyvų organizmų DNR replikacijoje. Dėl šio fermento genetinė informacija perduodama iš kartos į kartą. Eukariotuose ir prokariotuose yra įvairių DNR polimerazės fermentų formų. 1, 2 ir 3 DNR polimerazės yra tik prokariotiniuose organizmuose ir jos vaidina skirtingą vaidmenį replikuojant DNR. Pagrindinis skirtumas tarp DNR polimerazės 1 2 ir 3 daugiausia priklauso nuo kiekvieno fermento pagrindinės funkcijos. DNR polimerazė 3 yra pagrindinis fermentas, kuris katalizuoja DNR sintezę, o 1 ir 2 DNR polimerazė dalyvauja DNR taisyme ir korektūroje.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra DNR polimerazė
3. Kas yra DNR polimerazė 1
4. Kas yra DNR polimerazė 2
5. Kas yra DNR polimerazė 3
6. Gretimas palyginimas - DNR polimerazė 1 vs 2 vs 3
7. Santrauka
Kas yra DNR polimerazė?
DNR dublikatas yra būtinas norint perduoti genetinę informaciją iš tėvų palikuonims. Tai palengvina specialus fermentas, vadinamas DNR polimeraze. DNR polimerazę galima apibrėžti kaip visur esantį fermentą, kuris katalizuoja DNR sintezę, papildančią gyvose ląstelėse esančią DNR. Pirmą kartą jį E. colyje atrado Arthuras Kornbergas 1955 m. DNR replikaciją ir palaikymą daugiausia lemia ląstelėje esančios DNR polimerazės. DNR polimerazių atradimas padėjo daugeliui molekulinės biologijos metodų. Tai fermentas, reikalingas sintetinti naujas DNR grandines, panašias į pirminę organizmų DNR iš nukleotidų, atliekant daugelį molekulinių biologinių metodų, įskaitant PGR, genų klonavimą, genų sekos nustatymą, ligos diagnozę, genų terapiją, polimorfizmo analizę ir kt.
DNR polimerazės egzistuoja įvairiomis formomis, kurios skiriasi nuo formos ir dydžio. Jie priklauso kelioms šeimoms: A, B, C, D, X, Y ir RT. Prokariotinės DNR polimerazės yra suskirstytos į penkias skirtingas kategorijas, būtent, DNR polimerazę 1, DNR polimerazę 2, DNR polimerazę 3, DNR polimerazę 4 ir DNR polimerazę 5. Eukariotiniai organizmai turi maždaug penkiolika skirtingų DNR polimerazių, būtent polimerazės β, λ, σ, μ, α, δ, ε, η, ι, κ, Rev1, ζ, γ, θ ir ν.
01 paveikslas: DNR polimerazė
Sintetinant naują DNR, naudojant DNR polimerazę, ji prasideda nuo 3 'galo ir nukreipia sintezę link 5' galo, pridedant po vieną nukleotidą, papildantį matricos DNR. Norint pradėti grandinės sintezę, DNR polimerazei reikia iš anksto egzistuojančios 3 ’OH grupės, o ją palengvina mažas DNR ar RNR fragmentas, vadinamas pradmeniu. DNR polimerazė nuskaito DNR šabloną ir juda nuo 3 'galo iki 5' galo, padarydama naują 5'-3 'DNR grandinę.
Kas yra DNR polimerazė 1?
DNR polimerazė 1 (Pol 1) yra fermentas, randamas prokariotuose, kuris padeda replikuoti bakterijas. Tai pirmoji DNR polimerazės rūšis, kurią 1956 m. Atrado Arthuras Kornbergas. Šio fermento yra visuose prokariotiniuose organizmuose. Pol 1 koduojamas geno polA ir susideda iš 928 aminorūgščių. Jis turi 5 '- 3' egzonukleazės aktyvumą; taigi jis yra populiarus kaip DNR atstatantis fermentas, o ne DNR replikuojantis fermentas. Jis taip pat turi galimybę katalizuoti kelias polimerizacijas prieš išleidžiant DNR matricą ir sujungiant Okazaki fragmentus užpildant naują DNR ir pašalinant RNR pradmenis.
Pol 1, izoliuotas iš E Coli, buvo plačiai naudojamas molekulinėms reikmėms. Tačiau atradus „Taq Polymerase“, PCR technologijoje jis pakeitė „E Coli Pol 1“. Taq polimerazė yra tam tikra termostabili DNR polimerazė, priklausanti Pol 1.
02 paveikslas: DNR 1 polimerazė
Kas yra DNR polimerazė 2?
DNR polimerazė 2 (Pol 2) yra prokariotinis fermentas, kuris katalizuoja DNR replikaciją. Ji priklauso polimerazės B šeimai ir ją koduoja genas polB. Pirmą kartą iš „E Coli“jį atrado Thomas Kornbergas 1970 m. Pol 2 yra rutuliškas baltymas, sudarytas iš 783 aminorūgščių. Jis turi ir 3 '- 5' eksonukleazės aktyvumą, ir 5 '- 3' polimerazės aktyvumą. Jis sąveikauja su DNR polimerazės 3 fermentais, kad išlaikytų DNR replikacijos tikslumą ir procesyvumą. „Pol 2“taip pat turi galimybę tikrinti naujai sintezuotą DNR tikslumui.
03 paveikslas: DNR polimerazė 2
Kas yra DNR polimerazė 3?
DNR polimerazė 3 (Pol 3) yra pagrindinis fermentas, kuris katalizuoja DNR replikaciją prokariotuose. Ji priklauso C polimerazės šeimai ir ją koduoja genas polC. Tai atrado Thomas Kornbergas 1970 m. Pol 3 yra replikacijos šakės komponentas ir gali pridėti 1000 nukleotidų per sekundę prie naujai polimerizuojančios DNR grandinės.
Pol 3 yra holoenzimas, susidedantis iš dešimties skirtingų baltymų ir turintis tris funkcines molekules, būtent α, ε ir θ. Trys funkcinės Pol 3 molekulės yra atskirai atsakingos už tris fermento veiksmus. Α subvienetas valdo DNR polimerizaciją, o ε - pol 3 fermento egzonukleazės korektūros aktyvumą. Koreguoti θ subvienetas padeda ε subvienetui.
04 paveikslas: DNR polimerazės 3 subvienetai
Kuo skiriasi DNR 1, 2 ir 3 polimerazės?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
DNR polimerazė 1 vs 2 vs 3 |
|
| Polimerazė 1 | Polimerazę 1 sudaro 928 aminorūgštys. |
| Polimerazė 2 | Polimerazę 2 sudaro 783 aminorūgštys. |
| Polimerazė 3 | Polimerazė 3 yra holoenzimas, susidedantis iš dešimties baltymų, suskirstytų į tris funkcinius subvienetus. |
| Šeima | |
| Polimerazė 1 | 1 polimerazė priklauso A polimerazių šeimai. |
| Polimerazė 2 | Polimerazė 2 priklauso B polimerazių šeimai. |
| Polimerazė 3 | Polimerazė 3 priklauso C polimerazių šeimai. |
| Pagrindinė funkcija | |
| Polimerazė 1 | Tai yra atsakinga už DNR atkūrimą ir RNR pradmenų pašalinimą. |
| Polimerazė 2 | Tai yra atsakinga už naujai suformuotos DNR korektūrą, ištikimybę ir procesiškumą |
| Polimerazė 3 | Tai yra atsakinga už DNR polimerizaciją |
Santrauka - DNR polimerazė 1 vs 2 vs 3
DNR polimerazė yra svarbi fermentų klasė, randama visuose gyvuose organizmuose. Pagrindinė DNR polimerazės funkcija yra DNR replikacija. Jis sugeba surinkti nukleotidus ir sintezuoti naują esamą DNR papildančią DNR. Šis fermentas egzistuoja įvairiomis formomis, priklausomai nuo formos ir dydžio. 1, 2 ir 3 DNR polimerazės yra prokariotinės DNR polimerazės, dalyvaujančios DNR replikacijoje. Pol 1 katalizuoja DNR pažeidimų atitaisymą. Pol 2 katalizuoja DNR replikacijos tikslumą ir procesyvumą. Pol 3 katalizuoja nuo 5 'iki 3' DNR polimerizaciją.
