Pagrindinis skirtumas tarp atvirkštinės fazės ir normalios fazės HPLC yra tas, kad atvirkštinės fazės HPLC naudojama nepolinė stacionari fazė ir polinė mobili fazė, o įprastos fazės HPLC atveju naudojama polinė stacionari fazė ir mažiau polinė judri fazė.
Normalios fazės HPLC yra seniausia HPLC technika, kurią Tswettas naudojo atskirdamas augalų ekstraktus; stiklo kolonoje jis panaudojo kreidą. Tai buvo klasikinis chromatografijos būdas, kuris paskatino ją pavadinti „įprasta“technika. Kita vertus, atvirkštinės fazės HPLC yra priešinga įprastai technikai, kurią mokslininkai sukūrė pastaruoju metu.
