Pagrindinis skirtumas tarp nukleozidų ir nukleotidų atvirkštinės transkriptazės inhibitorių yra tas, kad nukleozidų atvirkštinės transkriptazės inhibitorius fosforilinti turėtų šeimininko ląstelių kinazės, o nukleotidų atvirkštinės transkriptazės inhibitoriams nereikia atlikti pradinės fosforilinimo.
Atvirkštinė transkriptazė yra fermentas, kuris RNR molekulę paverčia ssDNR. ŽIV ir retrovirusai turi šį fermentą, kad sintetintų ssDNR iš savo RNR genomo ląstelėje šeimininkėje. Taigi galima užkirsti kelią ŽIV ir kitų retrovirusų infekcijoms slopinant atvirkštinės transkriptazės fermento aktyvumą, tokiu būdu užkertant kelią virusų genomų sintezei ir virusų dauginimuisi. Atvirkštinės transkriptazės inhibitoriai yra antiretrovirusinių vaistų klasė, naudojama tokio tipo virusinėms infekcijoms gydyti. Šie vaistai nukreipti į atvirkštinės transkriptazės fermentą ir užkerta kelią jo kataliziniam poveikiui, blokuodami DNR sintezę iš virusinės RNR. Nukleozidų ir nukleotidų atvirkštinės transkriptazės inhibitoriai yra dviejų rūšių vaistai. Šie inhibitoriai yra labai svarbūs, ypač gydant AIDS.