Esminis skirtumas tarp biominavimo ir biologinio išplovimo yra tas, kad biominavimas yra prokariotų ar grybų panaudojimo būdas metalams iš mineralų išgauti, o biologinis valymas yra bakterijų panaudojimo būdas metalams iš mineralų išgauti.
Yra keli skirtingi metodai, kuriais galima išgauti metalus iš jų rūdos ar mineralinių atliekų. Daugumai šių metodų šiam ekstrahavimui naudojami cheminiai reagentai. Todėl kenksmingi šalutiniai produktai ir žalingas poveikis aplinkai yra įprasta šios technikos problema. Biologinis perdirbimas ir biologinis išplovimas yra metodai, kurie naudojami metalams iš rūdos išgauti naudojant gyvus organizmus.