Pagrindinis skirtumas tarp F plazmidės ir R plazmidės yra tas, kad F plazmidė yra ekstrachromosominė DNR, kurioje yra genų, koduojančių vaisingumo faktorių. Tuo tarpu R plazmidė yra ekstrachromosominė DNR, kurioje yra genų, koduojančių atsparumą antibiotikams.
Plazmidė yra maža apvali dviguba grandinė, esanti bakterijose. Jie yra ekstrachromosominė DNR ir gali save replikuoti. Jie turi genus, reikalingus jų savireplikacijai ir palaikymui. Be savęs replikacijai būtinų genų, plazmidėse yra ir keletas kitų būtinų genų, koduojančių specialius požymius, tokius kaip atsparumas antibiotikams, makromolekulių skaidymas, sunkiųjų metalų tolerancija, bakteriocinų gamyba, genų perkėlimas ir kt. naudinga bakterijoms.
Be to, yra labai daug plazmidžių. R plazmidės ir F plazmidės yra dviejų tipų. F plazmidė yra vaisingumo plazmidė, galinti konjuguoti ir gaminti lytinius pilius. R plazmidė yra atsparumo plazmidė, galinti užtikrinti atsparumą antibiotikams ir tam tikriems bakterijų augimo inhibitoriams.
