Pagrindinis skirtumas tarp hibridinių ir degeneracinių orbitalių yra tas, kad hibridinės orbitos yra naujos orbitos, susidarančios maišant dvi ar daugiau orbitalių, o degeneruotos orbitalės iš pradžių egzistuoja atome.
Kaip rodo jo pavadinimas, hibridinė orbita yra dviejų ar daugiau orbitų hibridas. Nors degeneracinės orbitos pavadinimas atrodo tas pats, jos nėra naujai susiformavusios orbitos - jos jau egzistuoja atome. Be to, visos hibridinės orbitos molekulėje turi tą pačią energiją, o degeneruotos orbitos atome turi tą pačią energiją.
