Pagrindinis skirtumas tarp smegenėlių ir smegenėlių yra tas, kad smegenėlės yra didžiausia priekinių smegenų dalis, o smegenėlės - didžiausia užpakalinių smegenų dalis.
Stuburinių gyvūnų nervų sistemą sudaro trys pagrindinės sistemos: centrinė nervų sistema, periferinė nervų sistema ir autonominė nervų sistema. Centrinė nervų sistema susideda iš dviejų pagrindinių dalių: smegenų ir nugaros smegenų. Smegenėlės ir smegenėlės yra dvi pagrindinės žmogaus smegenų dalys. Tačiau smegenėlės priklauso priekinėms smegenims, o smegenėlės - užpakalinėms. Šiame straipsnyje daugiausia dėmesio skiriama skirtumui tarp smegenėlių ir smegenėlių.