Pagrindinis skirtumas tarp citoplazmos ir protoplazmos yra tas, kad citoplazma yra protoplazmos dalis, į kurią neįeina branduolys, o protoplazma yra gyvas ląstelės, apimančios citoplazmą ir branduolį, turinys.
Ląstelė yra pagrindinis gyvųjų organizmų vienetas. Ląstelėje yra skirtingų komponentų, įskaitant ląstelių sieneles ir ląstelių membranas, branduolį, ląstelės organelius, citoplazmą, vandenį, įvairias skysčių medžiagas ir kt. Protoplazma veikia kaip fizinis gyvenimo pagrindas, ir ją daugiausia sudaro vanduo. Citoplazma ir protoplazma yra suspensijos, kurios palaiko organelius ir suteikia vietas atlikti visus biologinius procesus ląstelėje. Citoplazma yra protoplazmos dalis, kuri yra į želė panašus skystis ląstelėje.