Pagrindinis skirtumas tarp transformacijos ir transdukcijos yra tas, kad transformacija yra mechanizmas, keičiantis genetinę bakterijų medžiagą, tiesiogiai per ląstelės membraną įsisavinant egzogeninę genetinę medžiagą iš jos aplinkos ir įtraukiant ją į genomą, o pernešimas yra svetimos DNR injekcija. bakteriofago virusas patenka į šeimininko bakteriją.
Konjugacija yra gerai žinomas DNR rekombinacijos metodas, kurį galima rasti tiek eukariotuose, tiek prokariotuose. Mokslininkai atrado, kad įmanoma pernešti DNR iš vienos bakterinės ląstelės į kitą dar dviem mechanizmais: transformacija ir perdavimu. Panašiai kaip konjugacija, šie du mechanizmai perduoda DNR viena kryptimi, o rekombinacija vyksta tarp alelių homologiniuose DNR regionuose. Abu mechanizmai perduoda labai nedaug DNR ir neperduoda visos ląstelės chromosomos.