Pagrindinis skirtumas tarp mėlynųjų žaliųjų dumblių ir žaliųjų dumblių yra tas, kad žali dumbliai yra prokariotiniai organizmai, priklausantys Monera karalystei, o žalieji - eukariotiniai organizmai, priklausantys Kingdom Protista.
Fotosintezė yra fotoautotrofų parodytas procesas. Tai procesas, kuris sintetina angliavandenius (maisto produktus), surenkant saulės spindulių energiją. Procesui reikalingi fotosintetiniai pigmentai, CO 2 ir vanduo. Fotoautotrofai turi fotosintezės pigmentus fotosintezei atlikti. Yra trys pagrindinės fotoautotrofų grupės kaip augalai, melsvadumbliai (mėlyni žalieji dumbliai) ir dumbliai (įskaitant žaliuosius). Todėl ir mėlynosios, ir žaliosios dumbliai yra fotosintetiniai organizmai. Tačiau žali dumbliai yra prokariotiniai organizmai, o žali dumbliai - eukariotiniai organizmai. Atitinkamai yra skirtumas tarp mėlynųjų ir žaliųjų dumblių, atsižvelgiant į jų ląstelių organizaciją ir kitas savybes.