Esminis skirtumas tarp endotelio ir mezotelio yra tas, kad endotelis yra paprastas plokščio epitelio ląstelių sluoksnis, išklojantis visą kraujotakos sistemą, įskaitant kraujagysles, limfagysles ir širdį, o mezotelis yra paprastas plokščio epitelio ląstelių sluoksnis, išklojantis pagrindines kūno ertmes, tokias kaip: pilvaplėvė, pleura ir perikardas.
Epitelis, mezotelis ir endotelis yra trijų tipų ląstelių sluoksniai, išdėstantys mūsų vidaus organus, kūno ertmes ir odą. Vadinasi, jie visi yra apsauginiai kūno barjerai. Struktūriniu požiūriu mezotelis ir endotelis yra specializuoti arba modifikuoti mezoderminės kilmės epitelio sluoksniai. Atitinkamai jie susideda iš paprastų plokščių epitelio ląstelių. Tiek mezotelis, tiek endotelis yra viensluoksniai audiniai. Jie iškloja tam tikrus vidinius paviršius.
