Esminis skirtumas tarp mėšlo ir organinių medžiagų yra tas, kad mėšlas yra žmogaus sukurtų organinių medžiagų forma, o organinės medžiagos yra dirvožemyje natūraliai susidarantys anglies junginiai.
Augalai yra pagrindiniai pirminiai gamintojai mūsų ekosistemose. Taigi jie yra svarbūs tiekiant maistą kitiems gyvūnams, taip pat dalyvauja palaikant natūralią pusiausvyrą. Augalams augti taip pat reikia maisto ir vandens. Jie priklauso nuo dirvožemio maisto, vandens ir buveinių. Todėl dirvožemis turi būti sveikos būklės, o dirvožemio kokybei palaikyti būtinos organinės medžiagos. Organinės medžiagos yra junginiai, turintys anglies. Dirvožemyje yra daug organinių medžiagų formų. Priešingai, mėšlas yra žmogaus sukurtas ir jame yra visų būtinų maistinių medžiagų, reikalingų dirvožemio sveikatai pagerinti. Atitinkamai organinės medžiagos ir mėšlas yra dvi terminologijos, kurios yra labai svarbios dirvožemio biologijoje ir žemės ūkyje.
