Pagrindinis skirtumas tarp bioreaktoriaus ir fermentoriaus yra biocheminės reakcijos tipas, vykstantis uždaruose induose. Bioreaktorius palengvina visų rūšių biochemines reakcijas, tačiau fermentatorius palengvina tik fermentaciją.
Biotechnologijos taikymas pramonėje yra įdomi mokslo sritis. Šios paskirtys skiriasi nuo mikrobų naudojimo iki gyvūnų taikymo. Be to, pramoninė biotechnologijų taikymo sritis skiriasi skirtingose pagrindinėse srityse, tokiose kaip žemės ūkis, medicina ir įvairios pramonės šakos. Bioreaktoriai yra uždari indai, kuriuose yra sukurtos būtinos sąlygos palengvinti skirtingų tipų biochemines reakcijas. Fermentatoriai priklauso bioreaktorių grupei, tačiau tai ypač svarbu tik fermentacijai atlikti.
