Pagrindinis skirtumas tarp kalcio hipochlorito ir natrio hipochlorito yra tas, kad kalcio hipochlorite yra du hipochlorito anijonai, susiję su vienu kalcio katijonu, o natrio hipochlorite yra vienas hipochlorito anijonas, susijęs su vienu natrio katijonu. Išvaizda kalcio hipochloritas yra baltos arba pilkos spalvos milteliai, o natrio hipochloritas yra žalsvai geltona kieto kvapo kvapas.
Kalcis ir natrio hipochloritas yra joniniai junginiai, turintys metalo katijoną ir chloro daromą anijoną. Šių junginių katijonų anijonų skaičius skiriasi vienas nuo kito pagal metalo katijono valentingumą.