Pagrindinis skirtumas tarp poliaatominių jonų ir junginių yra tas, kad poliaatominiai jonai turi teigiamą arba neigiamą elektros krūvį, o junginiai neturi grynojo elektrinio krūvio.
Poliaatominis jonas yra terminas, kurį naudojame cheminėms rūšims, turinčioms du ar daugiau atomų, turinčių neigiamą arba teigiamą elektros krūvį, įvardyti. Šio jono elektrinis krūvis yra kiekvieno atomo elektronų skaičiaus rezultatas; jei elektronų yra daugiau nei bendras protonų skaičius atomuose, jis gauna grynąjį neigiamą krūvį ir atvirkščiai. Kita vertus, junginiai yra cheminės rūšys, neturinčios elektros krūvio. Jie turi vienodą elektronų ir protonų skaičių.