Pagrindinis skirtumas tarp homonuklearinių ir heterobranduolinių aromatinių junginių yra tas, kad homonukleariniuose aromatiniuose junginiuose žiedo struktūroje yra tų pačių cheminių elementų atomai, tuo tarpu heterobranduoliniuose aromatiniuose junginiuose žiedo struktūroje yra skirtingų cheminių elementų atomų.
Homobranduoliniai ir heterobranduoliniai aromatiniai junginiai yra organiniai junginiai, turintys žiedo struktūras. Šios žiedo struktūros turi arba identiškus, arba skirtingus atomus. Todėl jie turi skirtingas chemines ir fizines savybes, priklausomai nuo žiedo struktūrų atomų tipo.