Pagrindinis skirtumas - „Fusion“ir „Taq“polimerazė
DNR polimerazės yra plačiai naudojami molekulinės biologijos metoduose naudojami fermentai, taip pat natūraliai jų yra visuose organizmuose, kuriems atliekama DNR replikacija. Jie yra pagrindiniai polimerizuojantys fermentai, dalyvaujantys replikacijos metu. DNR polimerazė gali pridėti nukleotidų prie laisvo 3 ’DNR grandinės galo ir taip sukelti naujos grandinės pratęsimą. Šiuo metu, atsižvelgiant į molekulinę biologiją ligų diagnostikoje ir pramonėje, svarbu gaminti polimerazes, turinčias įvairių naudingų savybių. Tai padidina metodo tikslumą ir daro jį greitesniu metodu. Fuzija ir Taq polimerazė yra du komerciškai gaminami termostabilūs polimerazės fermentai, kurie naudojami specialiuose molekuliniuose procesuose. Fuzija yra DNR polimerazė, išskirta iš Pyrococcus furiosus ir daugiausia naudojama klonavimo eksperimentuose, siekiant padidinti ištikimybę. Taq DNR polimerazė yra standartinė DNR polimerazė, naudojama polimerazės grandininėje reakcijoje (PGR), ir ji išskiriama iš termostabilios bakterijos; Thermus aquaticus. Esminis šių dviejų fermentų skirtumas yra mikroorganizmas. Fuzija išskiriama iš ekstremofilo, Pyrococcus furiosus, o Taq polimerazė yra išskiriama iš termofilo, Thermus aquaticus. Taq polimerazė išskiriama iš termofilo Thermus aquaticus. Taq polimerazė išskiriama iš termofilo Thermus aquaticus.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra fuzija
3. Kas yra Taq polimerazė
4. Fuzijos ir Taq polimerazės panašumai
5. Gretinamasis palyginimas - fuzija ir Taq polimerazė lentelių pavidalu
6. Santrauka
Kas yra „Fusion“?
Fuzinės DNR polimerazė yra nauja polimerazė, gaminama išskiriant fermentą iš Pyrococcus furiosus, kuris yra ekstremofilinė Archaea. Šie mikrobai gyvena ypač aukštoje temperatūroje, todėl polimerazė tampa labai karščiui stabilia polimeraze. Fuzinė polimerazė naudojama norint gauti ypatingą tikslumą palyginti su įprastine termostabilia polimeraze; Taq polimerazė. Fuzinė polimerazė sugeba sustiprinti ilgus šablonus iki 7,5 kb genomos DNR. Optimalus polimerizacija talpa Phusion polimerazės yra 72 0 C. Phusion taip pat naudojamas klonuoti produktus sekos, ekspresijos analizės ir mutacijos analizė.
Fuzinės DNR polimerazės aktyvumas yra 3 '- 5'. Tai leidžia koreguoti naujai susintetintą giją po sintezės. Vadinasi, nukleotidų neatitikimai lengvai pašalinami. Taigi, jis turi mažesnį klaidų lygį. Bendrieji fuzinės polimerazės pranašumai yra;
- Itin ištikima
- Didelis greitis ir sutrumpintas pratęsimo laikas
- Tvirta reakcija ir reikalauja minimalaus optimizavimo
- Didelis derlius
01 pav. Fuzija
Pagrindinis fuzinės polimerazės trūkumas yra tas, kad ji slopinama esant dezoksiuridino trifosfatui (dUTP). Kai reakcijos mišinyje kaupiasi dUTP, tai gali slopinti fuzinės polimerazės veikimą. To išvengiama prieš pridedant fermento reakcijos mišinį apdorojant dUTPase. Šiuo metu vietoj fuzinės polimerazės kaip šios problemos sprendimas yra naudojamas dUTP atsparus fuzijinės polimerazės variantas, žinomas kaip Pfu Turbo.
Kas yra „Taq Polymerase“?
Taq DNR polimerazės išradimas pakeitė molekulinės biologijos sritį. Tai išsprendė pagrindinę DNR amplifikacijos problemą. Taq DNR polimerazė yra šilumai stabilus polimerazės fermentas, išgaunamas ir išskiriamas iš termofilinės bakterijos Thermus aquaticus. Atradus šiuos fermentus, vystosi PGR. Šis fermentas leido naudoti polimerazės grandininę reakciją atliekant DNR amplifikaciją, o ne įprastą sunkų klonavimo metodą. PGR dabar naudojamas molekulinėje diagnostikoje, žemės ūkio ir pramonės srityse, kuriai pridėta daug naujų variantų.
02 paveikslas: Taq polimerazė
Taq DNR polimerazė veikia esant optimaliam temperatūros intervalui tarp 72 0 C - 80 0 C. Taq DNR polimerazei reikalingas bendras faktorius; magnis dėl savo funkcijos. Taq polimerazė neturi 3 '- 5' korektūros galimybių, todėl Taq DNR polimerazės klaidų lygis yra didelis, palyginti su naujesnių tipų DNR polimerazėmis, tokiomis kaip fuzinė polimerazė ir kt. Tačiau Taq DNR polimerazės populiarumas išlieka tas pats visame mokslo pasaulyje dėl fermento patogumo ir lankstumo.
Kuo panašūs fuzija ir Taq polimerazė?
- Tiek „Phusion“, tiek „Taq“polimerazės fermentai yra polimerizuojantys fermentai, galintys pridėti nukleotidų prie 3 ’laisvo DNR grandinės galo.
- Tiek Phusion, tiek Taq polimerazėms reikalinga pradmenų seka, kad būtų pradėta polimerizacija.
- Tiek „Phusion“, tiek „Taq“polimerazės yra stabilios šilumai.
- Tiek Phusion, tiek Taq polimerazės naudojamos PGR mechanizmuose, siekiant sustiprinti DNR.
- Pridedant polimerazę į reakcijos mišinį, tiek Phusion, tiek Taq polimerazės pridedamos paskutinės, kad būtų užtikrintas fermento efektyvumas.
- Tiek Phusion, tiek Taq polimerazės yra komerciškai sintetinamos eksperimentinės molekulinės biologijos tikslais.
- Tiek „Phusion“, tiek „Taq“polimerazėms atlikti reikalingas kofaktorius.
Koks skirtumas tarp fuzijos ir Taq polimerazės?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
„Phusion vs Taq Polymerase“ |
|
| Fuzija yra DNR polimerazė, išskirta iš Pyrococcus furiosus ir daugiausia naudojama klonavimo eksperimentuose, siekiant padidinti ištikimybę. | Taq DNR polimerazė yra standartinė DNR polimerazė, naudojama polimerazės grandininėje reakcijoje (PGR), ir ji išskiriama iš termostabilios bakterijos Thermus aquaticus. |
| Šaltinis Organizmas | |
| Fuzija išgaunama iš ekstremofilinių archų - Pyrococcus furiosus. | Šie literatūros kūriniai tęsiasi nuo kolonizacijos iki dekolonizacijos laikotarpio. |
| Gebėjimas skaityti įrodymus | |
| 3–5 colių skaitymo gebėjimas yra „Phusion“. | Taq polimerazėje nėra 3–5 colių atsparumo skaitymui. |
| ištikimybė | |
| Aukšta ištikimybė yra su „Phusion“. | Taq polimerazė yra mažai ištikima. |
| Stiprinimas | |
| Fuzija sugeba sustiprinti ilgus DNR fragmentus. | Taq polimerazė sugeba sustiprinti daug trumpesnius DNR fragmentus. |
| apsinuodijimas dUTP | |
| Fuzijos veikimą slopina nelyginis kaupimasis. | TaUP polimerazės dUPT neslopina. |
Santrauka - fuzija ir Taq polimerazė
Fuzija ir Taq DNR polimerazė yra dvi šilumai stabilios polimerazės, kurios naudojamos PGR metoduose. Fuzija yra polimerazė, išskirta iš ekstremofilo, Pyrococcus furiosus, o Taq - nuo termostabilių bakterijų Thermus aquaticus. Taq DNR polimerazės atradimas sukelia PGR išradimą. Fuzija turi daug privalumų, palyginti su Taq, todėl Phusion tapo geresne galimybe gaminti aukštos kokybės DNR. Tačiau Taq polimerazė vis dar naudojama kaip standartinis polimerazės fermentas PGR. Tai yra skirtumas tarp Phusion ir Taq polimerazės.
