Pagrindinis skirtumas - bakterijų transpozazės ir retrovirusinės integracijos
Nešiojamoji genetinė medžiaga išsivystė įgyvendinant dvi pagrindines strategijas pereiti iš vieno regiono į kitą regioną viduje ir tarp genomų. Vienas iš būdų yra išstumti per RNR molekulę prieš susidarant DNR molekulei, o kitas būdas apima tarpinius DNR. Transposazės ir virusinės integrazės yra tokios perkeltinos genetinės medžiagos pavyzdžiai. Bakterijų transpozazės įvairiais mechanizmais jungiasi su transpozonų galu ir palengvina transpozono judėjimo į kitą genomo dalį katalizę. Retrovirusinės integrazės yra fermentai, padedantys integruoti retroviruso genetinę medžiagą, pvz., ŽIV, į ląstelės-šeimininkės, kurią ji užkrėsto, genetinę medžiagą (DNR). Tai yra pagrindinis skirtumas tarp bakterijų transpozazių ir retrovirusinių integrazių.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra bakterijų perkėlimas
3. Kas yra retrovirusinės integralai
4. Bakterijų transpozazių ir retrovirusinių integrazų panašumai
5. Šoninis palyginimas - bakterijų transpozazės ir retrovirusinės integrazės lentelės forma
6. Santrauka
Kas yra bakterijų perkėlimas?
Transposazę galima apibrėžti kaip fermentą, susietą su transpozonų galu, kuris įvairiais mechanizmais palengvina transpozono judėjimo į kitą genomo dalį katalizę. Tokie mechanizmai apima „iškirpimo ir įklijavimo mechanizmą“ir „replikacinį perkėlimo mechanizmą“. Pirmiausia transpozazė buvo įvedama klonavus fermentą, reikalingą transpozicijai Tn3 transpozonui. Perkeliami genetiniai elementai panaudojo dvi svarbias strategijas, kad būtų galima perkelti genomus arba iš vienos vietos į kitą. Transportavimas per RNR tarpinę dalį prieš DNR kopijos sintezę yra viena strategija, o kita yra susijusi tik su tarpiniais DNR. Rekombinacijos reakcijos, susijusios su abiejų elementų integravimu, vyksta dėl elementui būdingų fermentų. Taigi,DNR elementų atveju šie fermentai yra žinomi kaip transpozazės, o RNR elementai - kaip integrazės.
Lyginant abiejų perkėlimo strategijų skirtumus, atrodo, kad įterpimo procesas yra identiškas chemiškai. Tačiau naujausi duomenys rodo, kad tam tikri integracijos mechanizmo panašumai yra matomi aminorūgščių sekų, sudarančių aktyvią vietą, regionuose; DDE motyvas. Šiuo metu klasifikuojamos penkios transposazių šeimos, tačiau naujų transposazių simbolių dar nėra. Šeimos apima DDE transpozazę, tirozino (Y) transpozazę, serino (S) transpozazę, „Rolling Circle transposase“, atvirkštines transkriptazes / endonukleazes (RT / En) ir kt. Šios šeimos naudoja unikalius katalizinius mechanizmus DNR skaidymui ir sujungimui. DDE transpozazė įtraukia į pradinio transpozono pjaustymo ir įklijavimo mechanizmą ir turi tris konservuotų aminorūgščių rinkinius, būtent;aspartatas (D), aspartatas (D) ir glutamatas (E). Tirozino transpozazės taip pat dalyvauja pjaustymo ir įklijavimo mechanizme, naudojant tirozino liekanas, kurios yra specifinės vietai.
01 pav. Bakterijų perkėlimas
Serino transpozazės apima tarpinę žiedinės DNR dalį ir atlieka pjaustymo ir įklijavimo mechanizmą taip pat, kaip aukščiau nurodytos šeimos. Riedėjimo rato transpozazė įtraukia į kopijavimo mechanizmą, kai viena grandinė tiesiogiai nukopijuojama į tikslinę vietą per DNR replikaciją. Tai užtikrina, kad šablono gija ir nukopijuota gija turėtų naujai susintetintą giją. Atvirkštinės transkriptazės / endonukleazės transpozazė turi įvairius perkėlimo mechanizmus.
Kas yra retrovirusinės integralai?
Retrovirusinės integrazės kontekste jis laikomas retrovirusiniu fermentu, kuris padeda integruoti retroviruso genetinę medžiagą, pavyzdžiui, ŽIV, į užkrėstos ląstelės genetinę medžiagą (DNR). Šios retrovirusinės integrazės dažniausiai painiojamos su fagų integrazėmis. Fagų integralų pavyzdžiai yra λ fago integrazė. Bet tai yra visiškai skirtingi fermentai, kurių nereikėtų painioti. Retrovirusinės išankstinės integracijos komplekso formavimosi srityje pagrindinį vaidmenį atlieka retrovirusinė integrazė. Retrovirusinės integrazės baltymai paprastai susideda iš trijų (03) kanoninių sričių. Šiuos domenus jungia lanksčios nuorodos.
Trys domenai apima N galinį cinką surišančią sritį, kur trys spiraliniai ryšuliai yra sujungti ir stabilizuoti koordinuojant dalyvaujant Zn 2+katijonas, RNazės H kartus katalizinio šerdies domenas ir C galinės DNR surišančios domenas, kuris yra Tyrimas ir biocheminė bei struktūrinė informacija rodo, kad retrovirusinė integrazė gali veikti kaip dimerų dimeras (tetrameras). Multimerizacijos ir prisijungimo prie viruso DNR kontekste visi trys retrovirusinės integrazės baltymo domenai. Pagrindinė retrovirusinės integrazės funkcija yra įterpti jos genetinę medžiagą į DNR. Šis žingsnis yra pats svarbiausias ŽIV viruso replikacijos žingsnis. Kai jis bus sėkmingai integruotas, jis bus visą ląstelės chromosomų DNR visą savo gyvenimo trukmę.
02 pav. Retrovirusinės integrazės
Todėl, integravus, ląstelė negrąžinama. Šios retrovirusinės integrazės apima dviejų pagrindinių reakcijų, įskaitant 3 'galinį apdorojimą ir kovalentinį perrišimą, katalizavimą. 3 ’galinio apdorojimo metu 2-3 nukleotidai iš abiejų viruso DNR 3’ galų pašalinami siekiant atskleisti viruso DNR 3 ’galų CA dinukleotidus, o kovalentinio perrišimo metu - perdirbti 3’ galai. viruso DNR kovalentiškai perrišama į šeimininko chromosomų DNR.
Koks yra bakterijų transpozazių ir retrovirusų integralų panašumas?
Tiek bakterijų transpozazės, tiek retrovirusų integralai turi panašias aminorūgščių sekas
Koks skirtumas tarp bakterijų transpozazių ir retrovirusinių integralų?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Bakterijų transpozazės ir retrovirusų integralai |
|
| Bakterinė transpozazė yra fermentas, susietas su transpozonų galu, tuo pačiu palengvindamas transpozono judėjimo į kitą genomo dalį katalizę įvairiais mechanizmais. | Retrovirusinės integralos laikomos retrovirusiniu fermentu, kuris padeda integruoti retroviruso genetinę medžiagą, pavyzdžiui, ŽIV, į užkrėstos ląstelės genetinę medžiagą (DNR). |
| Privalomi regionai | |
| Bakterijų transpozazėms reikalingi aukšti specifiniai regionai. | Susijungimui reikalinga mažiau arba visai nereikia nukleotidų sekos. |
Santrauka - Bakterijų transpozazės ir retrovirusų integralai
Bakterijų transpozazės yra laikomos retrovirusiniu fermentu, kuris padeda integruoti retroviruso genetinę medžiagą, pavyzdžiui, ŽIV, į užkrėstos ląstelės genetinę medžiagą (DNR). Perkeliami genetiniai elementai panaudojo dvi svarbias strategijas, kad būtų galima perkelti genomus arba iš vienos vietos į kitą. Šiuo metu klasifikuojamos penkios transposazių šeimos, tačiau naujų transposazių simbolių dar nėra. Retrovirusinė integrazė yra laikoma retrovirusiniu fermentu, kuris padeda integruoti retroviruso genetinę medžiagą, pvz., ŽIV, į užkrėstos ląstelės genetinę medžiagą (DNR). Retrovirusinės integrazės baltymai paprastai susideda iš trijų (03) kanoninių sričių. Pagrindinė retrovirusinės integrazės funkcija yra įterpti jos genetinę medžiagą į DNR. Šis žingsnis yra pats svarbiausias ŽIV viruso replikacijos žingsnis. Todėl, integravus, ląstelė negrąžinama. Tuo skiriasi bakterijų transpozazės ir retrovirusinė integrazė.
Atsisiųskite bakterijų transpozazių ir retrovirusų integralų PDF rinkmeną
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia: Skirtumas tarp bakterijų transpozazių ir retrovirusinių integralų
