Pagrindinis skirtumas - genotipų nustatymas ir sekos nustatymas
Genotipo nustatymas ir sekvenavimas yra du metodai, atliekami norint gauti informacijos apie nukleorūgštis, daugiausia organizmo DNR. Esminis skirtumas tarp genotipo nustatymo ir sekvenavimo yra tas, kad genotipas yra procesas, kuriuo nustatant, kurį genetinį variantą individas turi, naudodamas žymenis, o sekvenavimas yra teisingos nukleotidų sekos nustatymas pateiktame DNR fragmente.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra genotipas
3. Kas yra sekos nustatymas
4. Palyginimas greta - genotipų nustatymas ir sekos nustatymas
5. Santrauka
Kas yra genotipas?
Genotipas yra asmens genetinės struktūros nustatymas naudojant DNR ir žymenų seką ir jos paveldėjimo palyginimas ir nustatymas. Genotipai yra svarbūs evoliucijos biologijoje, populiacijos biologijoje, taksonomijoje, ekologijoje ir organizmų genetikoje. Tai gali būti atliekama naudojant įvairius metodus, įskaitant DNR sekos nustatymą, polimerazės grandininę reakciją, restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmą (RFLP), atsitiktinį amplifikuotą polimorfinį aptikimą, amplifikuoto fragmento ilgio polimorfizmą (AFLP), DNR mikrodaleles ir kt.
Genotipas apima tam tikrų mažų DNR sekų fragmentų sekos nustatymą ir genetinės kompozicijos sąsajų su kitais asmenimis nustatymą naudojant genetinius žymenis. Tai nustato pavienių nukleotidų polimorfizmus (SNP) tarp individų ar specifinių alelių. Genotipas taikomas daugeliui organizmų, įskaitant žmones. Jis taip pat taikomas mikroorganizmams, tokiems kaip virusai, grybai ir kt., Ir gali būti naudojamas nustatant jų genetinius variantus pagal etaloninius profilius. Molekulinėje epidemiologijoje ir teismo mikrobiologijoje ligų sukėlėjų, ypač mikroorganizmų, kontrolė atliekama remiantis genotipų nustatymo informacija. Genotipai yra labai svarbūs analizuojant kilmę. Žmonės genotipais patvirtina motinystę ir tėvystę. Genotipas atskleis dominuojančius ir recesyvinius genų alelius, kurie nulemia specifinius bruožus.
_1 paveikslas: RFLP genotipų nustatymas
Kas yra sekos nustatymas?
Sekvenavimas yra procesas, kuriuo nustatoma teisinga nukleotido tvarka tam tikrame DNR ar RNR fragmente. Praktiškai visa organizmo augimui ir vystymuisi reikalinga informacija yra užkoduota jo genome. Kelių šimtų nukleotidų ilgio nukleorūgščių fragmentų gamybos ir atskyrimo metodų prieinamumas leido sukurti procedūras, pagal kurias nustatoma tiksli tam tikro DNR ar RNR fragmento nukleotidų seka. Šiandien yra skirtingų tipų sekos metodų. Šie sekvenavimo metodai kartu su genomo bibliotekų, vaizduojančių visą organizmo genomą, sudarymo technologijomis palengvina viso to organizmo genomo sekvenavimą, atliekant išsamią genų struktūrų, genų funkcijų, genų lokalizacijos, genų išraiškų analizę, genų kartografavimas, genų reguliavimo regionai ir kt.
Daugelio virusų, kelių bakterijų, archebakterijų, mielių ir kelių kitų organizmų genomas buvo sekvenuotas ir atvaizduotas. Žmogaus genomo projektas leido suskirstyti ir atvaizduoti visą žmogaus genomą ir paskelbti jo pirmąjį projektą 2003 m. Tai yra svarbus biologijos pažangos etapas. Žmogaus genomo sekos dabar naudojamos medicinos sektoriuje nustatant retų ligų genetines priežastis, tiriant naujagimių ligų riziką, nustatant skirtingų vėžio rūšių genetines detales, kuriant naujas terapines priemones ir kuriant naujas diagnostikos priemones ir kt.
Augalų pasaulyje buvo sekvenuoti ryžių ir Arabidopsis genomai. Šių sekų žinojimas neabejotinai pakeis mūsų supratimą apie ląstelių ir organizmų funkcionavimą.
_2 pav. Dainų sekos autoradiografas
Kuo skiriasi genotipai ir sekos?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Genotipo nustatymas ir sekos nustatymas |
|
| Genotipas yra individo genetinės sudėties nustatymo ir grupės ar taksonomijos patikrinimo procesas. | Sekvenavimas yra tikslios tam tikros DNR ar RNR fragmento nukleotidų eilės nustatymo procesas. |
| Technikos | |
| RFLP, genų sekos nustatymas, PGR, DNR mikrodalelės, AFLP ir kt. | Sanger sekos, Gilbert sekos, Pyrosequencing, naujos kartos sekos, Shotgun sekos ir kt. |
| Pagrindiniai rūpesčiai | |
| Tai labiau rūpi, ar genotipų skirtumai duoda faktinius fenotipų skirtumus. | Tai labiau rūpi nukleotidų tvarka ir skirtumai bei pokyčiai su kitais organizmais. |
Santrauka - genotipų nustatymas ir sekos nustatymas
Genotipų nustatymas ir sekos nustatymas yra naudingi tiriant organizmų genetinę informaciją. Genotipas yra procesas, kuriuo nustatomi individų genotipo pokyčiai ir nustatomos jų kategorijos. Sekvenavimas yra procesas, kurio metu nustatoma teisinga nukleotidų tvarka susidomėjusiame fragmente arba DNR srityje. Abu metodai suteikia svarbios informacijos apie genus ir genomus.
