Agarozė ir poliakrilamidas
Agarozė ir poliakrilamidas yra vandenyje tirpūs polimerai, tačiau tarp jų galima pastebėti daug skirtumų, pradedant jų kilme. Tiek agarozė, tiek poliakrilamidas turi kažką bendro dėl jų gebėjimo formuoti porėtas gelio matricas. Nepaisant to, tarp jų yra keletas skirtingų skirtumų. Pagrindiniai abiejų šių polimerų skirtumai yra jų kilmės pobūdis, cheminė sandara, skirtingi panaudojimo būdai ir gelio elektroforezės efektyvumas.
Kas yra Agarose?
Agarozė yra natūraliai atsirandantis linijinis polimeras, kuris savo ruožtu gaunamas iš kompleksinio polimero, vadinamo agaru, esančio jūros dumbliuose. Agarozė išgaunama iš agaro pašalinant baltymo komponentą, vadinamą agaropektinu. Agarozė yra tai, kas suteikia agarui galimybę formuoti gelius.
Pagrindinis agarozės panaudojimas atliekamas atliekant mikrobiologinius ir molekulinius biologinius tyrimus. Atliekant mikrobiologinius tyrimus, agarozė, papildyta tinkamomis maistinėmis medžiagomis, suteikia tvirtą pagrindą mikroorganizmams, tokiems kaip bakterijos ir grybai, auginti. Naudojant pusiau kietomis koncentracijomis, tai gali būti naudinga vertinant šių mikroorganizmų judrumą. Molekulinėje biologijoje jis yra svarbus įrankis vienam iš svarbiausių skiriamųjų procesų, vadinamų „gelio elektroforeze“arba „agarozės gelio elektroforeze“(AGE). Gelio elektroforezė yra procesas, leidžiantis išskaidyti arba atskirti nukleorūgštis ar baltymą pagal jų dydį ir krūvį. Čia agarozė tarnauja kaip porėtas į sietą panašus gelis, per kurį vyksta atskyrimas.
Agarozės struktūra
Kas yra poliakrilamidas?
Poliakrilamidas yra sintetinis polimeras ir naudojamas įvairiose pramonės šakose. Kaip minėta anksčiau, jo naudojimas priklauso nuo jo gebėjimo formuoti gelius. Tačiau, be to, įvairiose pramonės šakose taip pat išnaudojamas jo gebėjimas sulaikyti ir nutekėti skirtingos koncentracijos vandenį.
Plačiausiai ir dažniausiai poliakrilamidas naudojamas nuotekų valymui. Čia jis naudojamas kaip flokuliatorius pašalinant bet kokias suspenduotas organines medžiagas; taigi, drumstumo gerinimas ir vandens skaidrinimas. Kitas poliakrilamido panaudojimas yra popieriaus pramonė. Čia jis naudojamas sulaikyti arba išleisti vandenį iš popieriaus plaušienos, jei reikia. Panašiai žemės ūkio ir statybos pramonėje jis naudojamas kaip dirvožemio kondicionierius, siekiant užkirsti kelią dirvožemio erozijai ir pagerinti jo kokybę.
Kaip ir agarozė, poliakrilamidas taip pat naudojamas molekulinėje biologijoje kaip svarbi skiriamoji priemonė panašiame procese, vadinamame „Poliakrilamido gelio elektroforeze“(PAGE). Be viso to, poliakrilamidas taip pat naudojamas rūdos apdirbimui ir flokuliacinės medžiagos gamybai, kad būtų pašalintos visos suspenduotos organinės medžiagos; taigi, drumstumo gerinimas ir vandens skaidrinimas. Kitas poliakrilamido panaudojimas yra popieriaus pramonė. Čia jis naudojamas sulaikyti arba išleisti vandenį iš popieriaus plaušienos, jei reikia. Panašiai žemės ūkio ir statybos pramonėje jis naudojamas kaip dirvožemio kondicionierius, siekiant užkirsti kelią dirvožemio erozijai ir pagerinti jo kokybę. Be viso to, poliakrilamidas taip pat naudojamas gaminant maisto priedus, minkštus kontaktinius lęšius ir tekstilės gaminius.
Poliakrilamido struktūra
Koks skirtumas tarp agarozės ir poliakrilamido?
Agarozės ir poliakrilamido kilmė:
Agarozė: Agarozė yra natūralios kilmės polimeras. Jis gaunamas iš jūros dumblių.
Poliakrilamidas: Poliakrilamidas yra sintetinės kilmės ir jo nėra jokiomis natūraliomis aplinkybėmis.
Agarozės ir poliakrilamido molekulinė formulė:
Agarozė: Agarozės molekulinė formulė yra C 24 H 38 O 19.
Poliakrilamidas: Poliakrilamido molekulinė formulė yra (C 3 H 5 NO) n.
Cheminė agarozės ir poliakrilamido struktūra:
Agarozė: Agarozė yra tiesinis polisacharidas. Jį sudaro pasikartojantys disacharidų vienetai, vadinami agrobioze, kuriuos laiko vandenilio jungtys.
Poliakrilamidas: Poliakrilamidas yra chemiškai susietas polimeras. Jis susideda iš akrilamido monomerų ir kryžminio jungiklio N, N'-metilebisakrilamido.
Agarozės ir poliakrilamido toksiškumas:
Agarozė: tiek agarozė, tiek jos monomerų agrotozė yra netoksiško pobūdžio.
Poliakrilamidas: monomerinis poliakrilamido vienetas, akrilamidas, yra tariamas kancerogenas ir žinomas neurotoksinas, o jo polimerizuota forma nėra toksiška.
Agarozės ir poliakrilamido gelių charakteristikos:
AMŽIUS ir PUSLAPIS:
Agarozė: Agarozės gelio paruošimas AGE yra mažiau laiko reikalaujantis, lengvas ir paprastas, jam nereikia iniciatoriaus ar polimerizuojančio katalizatoriaus.
Poliakrilamidas: Poliakrilamido gelio paruošimas PAGE yra daug laiko reikalaujantis ir varginantis procesas, taip pat reikalingas iniciatorius (amonio persulfatas) ir polimerizuojantis katalizatorius (N, N, N ', N'-tetrametiletiletilaminas - TEMED).
Gamta:
Poliakrilamido geliai yra chemiškai stabilesni nei agarozės geliai.
Poros dydis:
Atsižvelgiant į tą pačią koncentraciją, poliakrilamido gelio matricų porų dydis paprastai būna mažesnis nei agarozės gelio matricos.
Poros dydžio keitimas:
Poliakrilamido gelių porų dydis gali būti pakeistas labiau kontroliuojamu būdu nei agarozės gelių.
Sprendimo galia:
Poliakrilamido geliai turi didelę skiriamąją galią, o agarozės geliai - mažą skiriamąją galią.
Laikoma nukleorūgštis:
Poliakrilamido geliai gali skirti didesnį nukleino rūgšties kiekį nei agarozės geliai, kad būtų skiriama.
Vaizdai mandagūs: agarozė ir poliakrilamido struktūra per „Wikicommons“(viešasis domenas)
