Esminis skirtumas tarp transgeninių ir nokautinių pelių yra tas, kad transgeninių pelių svetimi genai yra įterpti į jos genomą, o nokautinės pelės turi funkciškai neaktyvų geną.
Genų inžinerija yra genetikos sritis, kurioje organizmo genetinė struktūra modifikuojama arba manipuliuojama rekombinantinės DNR technologijos pagalba. Transgeniniai organizmai gaminami įvedant į organizmus svetimus genus (transgenus), naudojant biotechnologijas. Jie taip pat vadinami genetiškai modifikuotais organizmais. Transgeniniai organizmai yra vertingos tyrimo priemonės. Jie yra svarbūs tiriant geno funkciją, genų terapijoje ir žemės ūkyje. Pelės naudojamos kaip laboratoriniai gyvūnų modeliai, nes jos yra labiau susijusios su žmonėmis. Transgeninės pelės ir nokautinės pelės yra dviejų tipų genetiškai modifikuoti gyvūnai. Transgeninėse pelėse šeimininko DNR vietoje yra pakeista kita to paties geno versija arba visiškai kitu genu. Išjungtose pelėse šeimininko genas paprasčiausiai pašalinamas arba funkciškai inaktyvuojamas.
