Pagrindinis skirtumas tarp blakstienų stereocilijų ir mikrovilių yra tas, kad blakstienos yra mažytės į plaukus panašios struktūros, sudarytos iš mikrovamzdelių, tuo tarpu stereocilijos yra į plaukus panašių projekcijų pluoštai, sudaryti iš aktino gijų, o mikrovilliai - iš aktino gijų sudarytų ląstelių membranų klostės.
Žiūrint iš išorės, blakstienos, stereocilijos ir mikrovilės gali atrodyti kaip panašios struktūros. Bet jie struktūriškai ir funkciškai skiriasi vienas nuo kito. Jie yra į plaukus panašios struktūros, kurios yra mikroskopinės. Be to, jie yra baltymų pluoštai, besitęsiantys iš ląstelių.