Pagrindinis skirtumas tarp anamokso ir denitrifikacijos yra tas, kad anamoksas reiškia anaerobinę amonio oksidaciją, kuri anoksinėmis sąlygomis amonį ir nitritus paverčia azoto dujomis. Tuo tarpu, nors denitrifikacija yra biologinė nitrato transformacija į N 2 denitrifikuojant bakterijas.
Azoto ciklas yra svarbus biogeocheminis ciklas, kurio metu azotas virsta skirtingomis cheminėmis formomis, tokiomis kaip NH 3, NH 4 +, NO 2 -, NO 3 -ir tt Yra keturi pagrindiniai azoto ciklo procesai. Tai fiksacija, amonifikacija, nitrifikacija ir denitrifikacija. Daugelį šių procesų vykdo mikroorganizmai, ypač dirvožemyje esančios bakterijos. „Anammox“yra vienas iš naujausių azoto ciklo papildymų. Tai anaerobinio amonio oksidacijos procesas. Šį procesą vykdo tam tikra bakterijų grupė, vadinama planktomicetais. Jie turi specialią organelę, vadinamą anammoksosomomis, kuri suteikia vietą anamokso reakcijai. Tačiau galiausiai tiek denitrifikacija, tiek anamoksas gamina azoto dujas.
