Pagrindinis skirtumas - CRISPR ir RNAi
Genomo redagavimas ir genų modifikavimas yra artimiausia genetikos ir molekulinės biologijos sritis. Genų modifikacija yra plačiai taikoma atliekant genų terapijos tyrimus, taip pat naudojama geno savybėms, geno funkcionalumui ir geno mutacijoms nustatyti, kaip geno mutacijos gali paveikti jo funkciją. Svarbu sukurti efektyvius ir patikimus būdus tiksliems, tikslingiems gyvų ląstelių genomo pokyčiams. Tokie metodai kaip CRISPR ir RNAi naudojami genams modifikuoti labai tiksliai. CRISPR arba „Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats“yra natūraliai pasitaikantis prokariotinės imuninės gynybos mechanizmas, kuris neseniai buvo naudojamas eukariotinių genų redagavimui ir modifikavimui. RNR arba RNR trukdžiai yra specifinis sekos būdas nutildyti genus, įvedant mažą dvigubą grandinę RNR, kuri tarpininkauja su nukleino rūgštimis ir reguliuoja genų ekspresiją. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp CRISPR ir RNAi.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra CRISPR
3. Kas yra RNAi
4. CRISPR ir RNAi panašumai
5. Šalia palyginimas - CRISPR ir RNAi lentelių pavidalu
6. Santrauka
Kas yra CRISPR?
CRISPR sistema yra natūralus mechanizmas, esantis kai kuriose bakterijose, įskaitant E. coli ir archea. Tai prisitaikanti imuninė apsauga nuo svetimų DNR pagrįstų invazijų. Tai yra sekai būdingas mechanizmas. CRISPR sistemoje yra keli DNR pakartojimo elementai. Šie elementai įsiterpia į trumpas „tarpinių“sekas, gautas iš svetimos DNR ir daugelio Cas genų. Kai kurie Cas genai yra nukleazės. Taigi visa imuninė sistema vadinama CRISPR / Cas sistema.
01 pav. CRISPR / Cas sistema
CRISPR / Cas sistema veikia keturiais etapais.
- Sistema genetiškai pririša invazinius fagų ir plazmidžių DNR segmentus (tarpiklius) į CRISPR lokusus (vadinamus tarpiklių įgijimo žingsniu).
- crRNR brandinimo etapas. Šeimininkas perrašo ir apdoroja CRISPR lokusus, kad generuotų brandžią CRISPR RNR (crRNR), turinčią tiek CRISPR pakartotinius elementus, tiek integruotus tarpinius elementus.
- CrRNR nustatymas - tai palengvina papildomas bazių susiejimas. Tai svarbu, kai yra infekcija ir infekcinis agentas.
- Tikslinis interferencijos žingsnis - crRNR aptinka svetimą DNR, sudaro kompleksą su svetima DNR ir apsaugo šeimininką nuo svetimos DNR.
Šiuo metu CRISPR / Cas sistema naudojama pakeisti ar modifikuoti žinduolių genomą transkripcijos represijomis arba aktyvacija. Žinduolio ląstelės gali reaguoti į CRISPR / Cas9 tarpininkaujančias DNR pertraukas, pritaikydamos taisymo mechanizmą. Tai gali būti padaryta naudojant ne homologinį sujungimo galu metodą (NHEJ) arba homologinį nukreiptą taisymą (HDR). Abu šie remonto mechanizmai vyksta įvedant dvigubas gijas. Dėl to redaguojamas žinduolio genas. Taigi šiuo metu CRISPR / Cas sistema naudojama terapijos, biomedicinos, žemės ūkio ir mokslinių tyrimų srityse.
Kas yra RNAi?
RNR trukdžiai yra dvigubos grandinės RNR medijuojama technika, naudojama genų ekspresijai reguliuoti. Pagrindinis susijęs junginys yra mažos trukdančios RNR (siRNR). SiRNR yra specialus dvigubų grandinių RNR tipas su dviejų nukleotidų 3 'perdanga ir 5' fosfatų grupe. RNR trukdžių metu susidaro RNR sukeltas nutildymo kompleksas (RISC), dėl kurio su siRNR susijungęs genas gali degraduoti.
02 paveikslas: RNAi
RNAi procedūra yra tokia.
- Dviejų grandžių RNR bus apdorota citoplazmoje naudojant RNazės III tipo endoribonukleazę, vadinamą „Dicer“, kad būtų sukurta ~ 21 nukleotido ilgio siRNR.
- SiRNR surišto Dicerio perkėlimas į Argonaute, naudojant dvigubos grandinės RNR rišančius baltymus (dsRNABP).
- Argonauto susiejimas su viena duplekso kryptimi (kreipiamoji grandinė). Tai išstums kitą sruogą. Dėl to susidaro viso baltymo - RNR kompleksas, kuris vadinamas RISC.
- RISC komplekso susiejimas su viengrande orientuota RNR, sujungta su Argonaute.
- Homologinio RNR taikinio susiejimas su orientacine RNR.
- Argonauto aktyvinimas, dėl kurio suskaidoma tikslinė RNR
Koks CRISPR ir RNAi panašumas?
Abi yra naudojamos kaip genų ekspresiją modifikuojančios tyrimo priemonės
Koks skirtumas tarp CRISPR ir RNAi?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
CRISPR ir RNAi |
|
| CRISPR yra imuninės gynybos mechanizmas, kuris neseniai buvo naudojamas eukariotinių genų redagavimui ir modifikavimui. | RNAi yra sekai būdingas būdas nutildyti genus, įvedant mažas dvigubas grandines |
| Taikymo seka | |
| Sintetinė RNR (orientacinė RNR) yra tikslinė CRISPR seka. | siRNR yra tikslinė RNr seka. |
| Genų slopinimo efektyvumas | |
| Mažai CRISPR | Daug RNAi |
| Efektai | |
| Genų nukopijavimas įvyksta CRISPR. | RNAi įvyksta nokautas / nutildymas. |
Santrauka - CRISPR ir RNAi
CRISPR arba „Clusterered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats“yra natūraliai pasitaikantis prokariotinės imuninės gynybos mechanizmas, kuris neseniai buvo naudojamas eukariotinių genų redagavimui ir modifikavimui. RNR arba RNR trukdžiai yra specifinis sekos būdas nutildyti genus, įvedant mažą dvigubą grandinę RNR, kuri tarpininkauja su nukleino rūgštimis ir reguliuoja genų ekspresiją. Tai galima laikyti pagrindiniu CRISPR ir RNAi skirtumu. Abi technologijos, CRISPR / Cas ir RNAi, yra galingos manipuliavimo genais priemonės, nors CRISPR / Cas tikrai yra pranašesnė už RNAi, nes gali būti naudojama tiek įterpimams, tiek delecijoms sukelti. CRISPR / Cas sistemoje taip pat didelis specifiškumas.
Atsisiųskite CRISPR ir RNAi PDF versiją
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia Skirtumas tarp CRISPR ir RNAi
