Pagrindinis skirtumas tarp klonavimo vektoriaus ir ekspresijos vektoriaus yra tas, kad klonuojantis vektorius perneša svetimą DNR fragmentą į ląstelę šeimininką, o ekspresijos vektorius palengvina genų ekspresiją į baltymus.
Vektorius yra svarbus molekulinės biologijos terminas. Taikant rekombinantinę DNR technologiją, pagrindinis vektoriaus vaidmuo yra numatyti transporto būdą į naudingą DNR frakciją, kuri bus įterpta į ląstelę-šeimininką. Be to, tai yra DNR molekulė, naudojama svetimam DNR fragmentui dirbtinai pernešti į ląstelę-šeimininką, kad ji būtų ekspresuojama ar pakartojama. Dažniausiai naudojami vektoriai yra plazmidės, virusiniai vektoriai, kosmidės ir dirbtinės chromosomos. Klonavimo vektorius ir ekspresijos vektorius yra dviejų tipų vektoriai, klasifikuojami pagal jų taikymą.