Esminis skirtumas tarp genų amplifikacijos ir genų klonavimo yra tas, kad genų amplifikacija yra daugelio dominančio geno kopijų in vitro pasidarymas polimerazės grandinės reakcijos būdu. Tačiau genų klonavimas yra procesas, kai in vivo gaunama daugybė dominančio geno kopijų, gaminant rekombinantinę plazmidę ir transformuojant ją į bakteriją-šeimininkę.
Genas yra specifinis DNR fragmentas, koduojantis baltymą. Organizmas turi tūkstančius genų. Be to, naudojant molekulinius biologinius metodus įmanoma padauginti svarbių genų DNR sekas. Genų amplifikacija ir genų klonavimas yra dvi tokios procedūros. Abi procedūros sukuria daug dominančio geno kopijų. Tačiau pagal jų metodiką yra skirtumas tarp genų amplifikacijos ir genų klonavimo.
