Pagrindinis skirtumas tarp kariotipo ir idiogramos yra tas, kad kariotipas yra tikrasis visų ląstelių chromosomų vaizdas, o idiograma yra schematinė kariotipo schema, iliustruojanti visus chromosomų žemėlapius.
Chromosomų rinkinys atspindi organizmo genomą ir genetinę informaciją. Kiekviena chromosoma turi unikalią formą, dydį ir genų rinkinį. Chromosomų skaičius ir fizinė struktūra atskleidžia svarbią informaciją apie organizmą. Kariotipavimas yra metodas, skirtas ištirti visą ląstelės chromosomų rinkinį. Šio testo metu surenkamos ir analizuojamos visos chromosomos, siekiant nustatyti, ar chromosomose yra skaitinių ar struktūrinių anomalijų. Faktinis vaizdas, rodantis visas ląstelės chromosomas, yra kariotipas, o visų ląstelių chromosomų schema yra idiograma. Abi yra svarbios atliekant citogenetinius tyrimus.